지혜의 샘 교육관에서는 '나라와 민족을 위하여, 교회를 위하여, 민족 화해와 일치(평화 통일)을 위하여, 개인 기도 지향을 위하여' 라는 기도 지향을 가지고 11시간 지속적인 중재기도 프로그램을 통해 기도 훈련을 하고 있으며, 매일 1층 중재기도실과 5층 대강의실에서 연도와 묵주기도가 봉헌됩니다.

 카이로저스와 함께 하는 찬양은 프로그램을 더 풍요롭고 은혜롭게 만들어줍니다. 찬양을 통해 하느님께서 우리에게 베푸신 사랑을 기쁘게 표현할 수 있도록 매일 찬양 시간을 따로 두었으며, 미사와 철야 기도회에서는 더 풍성한 찬양으로 은총의 깊이를 더해줍니다.

 성경 전체의 핵심 내용을 체계적으로 정리하며 주요 사건과 인물을 깊이 묵상하는 성경 강의는 성경의 본문과 소 제목들을 쉽게 외울 수 있는 성경 도형 틀 강의, 성경 전체의 핵심 내용과 주요 사건 및 인물을 묵상할 수 있는 성경 핵심 특강, 성경 본문의 연구를 통해 얻어지는 메시지로 신앙에 변화를 주는 성경 강해, 신학을 이해하고 공부하는 신학 강의가 있습니다.

 미사는 하느님께 드리는 거룩한 제사입니다. 지혜의 샘 교육관 5층에서는 하루도 빠짐없이 매일 미사가 봉헌되며 영세 받기 원하는 이들, 냉담 회두를 원하는 이들, 영적 또는 내적 치유나 육적 치유를 원하는 이들, 망자(낙태 영혼), 악습에서의 해방을 원하는 이들을 위한 봉헌을 받고 있습니다.

 성경 통독 프로그램은 신자들이 성경을 읽고, 성경을 살고, 성경을 선포할 수 있도록 도와주는 것을 목표로 합니다. 창세기부터 묵시록까지 성경을 소리 내어 읽음으로써 성경 말씀을 내 안에 새기고 말씀대로 살 수 있도록 훈련하는 프로그램입니다.

 저희 지혜의 샘은 치유 말씀과 내적 치유라는 주제를 가지고 매주 금요일 밤 10시부터 익일 새벽 4시 30분까지 철야 기도회를 진행합니다. 미사를 시작으로 성시간, 연도, 찬양과 치유 말씀 강의로 이어지며 내적 치유 기도를 마지막으로 기도회가 마무리됩니다.

 깊이 통회하는 마음으로 성시간에 참여하는 이에게는 10년의 한대사(부분 대사)가 주어지며, 1933년 교황 비오 11세는 성시간에 참여한 자로서 고해성사와 영성체를 하고 교황의 지향대로 기도하는 이에게 전대사를 허락하였습니다. 지혜의 샘에서는 매주 수요일과 금요일, 두 번의 성시간을 두어 성체 조배의 은총을 열어놓았습니다.